Menselijk gemethyleerd NDRG4/SEPT9/SFRP2/BMP3/SDC2-gen
Productnaam
HWTS-OT077-humaan gemethyleerde NDRG4/SEPT9/SFRP2/BMP3/SDC2 gendetectiekit (fluorescentie-PCR)
Certificaat
CE
Epidemiologie
Bij volwassenen vallen dagelijks meer dan 108 darmepitheelcellen van de darmwand en worden via de peristaltiek van de dikke darm met de ontlasting uitgescheiden.Omdat de tumorcellen waarschijnlijker uit het darmkanaal vallen door de abnormale proliferatie, bevat de ontlasting van darmtumorpatiënten veel zieke cellen en abnormale celcomponenten, wat de materiële basis vormt voor stabiele ontlastingsdetectie.Uit onderzoek is gebleken dat methyleringsmodificatie van genpromoters een vroege gebeurtenis is bij het ontstaan van tumoren, en dat genetisch materiaal verkregen uit ontlastingsmonsters van colorectale kankerpatiënten de aanwezigheid van kanker in de darm eerder kan weerspiegelen.
NDRG4, ook bekend als SMAP-8 en BDM1, is een van de vier leden van de NDRG-genfamilie (NDRG1-4), waarvan is aangetoond dat deze geassocieerd is met celproliferatie, differentiatie, ontwikkeling en stress.Het is geverifieerd dat NDRG4-methylering een potentiële biomarker is voor niet-invasieve detectie van colorectale kanker in ontlastingsmonsters.
SEPT9 is een lid van de Septin-genfamilie, die bestaat uit ten minste 13 genen die coderen voor een geconserveerd GTPase-domein dat cytoskelet-gerelateerde eiwitten kan binden, en wordt geassocieerd met celdeling en tumorigenese.Studies hebben aangetoond dat het gemethyleerde Septin9-gengehalte kenmerkend verhoogd is in ontlastingsmonsters van patiënten met colorectale kanker.
Uitgescheiden frizzled-gerelateerde eiwitten (sFRP's) zijn oplosbare eiwitten die een klasse van Wnt-pathway-antagonisten zijn vanwege hun hoge structurele homologie met de frizzled (Fz) receptor voor Wnt-signalering.Inactivatie van het SFRP-gen resulteert in ongecontroleerde activering van Wnt-signalering geassocieerd met colorectale kanker.Momenteel kan SFRP2-methylering in ontlasting worden gebruikt als een niet-invasieve biomarker voor de diagnose van colorectale kanker.
BMP3 is een lid van de TGF-B-superfamilie en speelt dus een belangrijke rol in de embryonale ontwikkeling door vroege botvorming te induceren en vorm te geven.BMP3 is gehypermethyleerd bij colorectale kanker en kan worden gebruikt als een belangrijke tumormarker.
SDC2 is een heparansulfaatproteoglycaan op het celoppervlak dat betrokken is bij de regulatie van veel fysiologische en pathologische processen.Fysieke processen omvatten celproliferatie, differentiatie, adhesie, organisatie van het cytoskelet, migratie, wondgenezing, cel-matrixcommunicatie, angiogenese;Pathologische processen omvatten ontstekingen en kanker.Het methyleringsniveau van het SDC2-gen in colorectale kankerweefsels was significant hoger dan dat in normale weefsels.
Kanaal
Reactiebuffer A | VIC/HEX | gemethyleerd NDRG4-gen |
ROX | gemethyleerd SEPT9-gen | |
CY5 | interne controle | |
Reactiebuffer B | VIC/HEX | gemethyleerd SFRP2-gen |
ROX | gemethyleerd BMP3-gen | |
FAM | gemethyleerd SDC2-gen | |
CY5 | interne controle |
Interpretatie
Gen | Signaalkanaal | CT-waarde | Interpretatie |
NDRG4 | VIC (HEX) | Ct-waarde≤38 | NDRG4 positief |
Ct-waarde>38 of onder | NDRG4 negatief | ||
9 september | ROX | Ct-waarde≤38 | SEPT9 positief |
Ct-waarde>38 of onder | SEPT9 negatief | ||
SFRP2 | VIC (HEX) | Ct-waarde≤38 | SFRP2 positief |
Ct-waarde>38 of onder | SFRP2 negatief |
Technische parameters
Opslag | Vloeistof: ≤-18℃ |
Houdbaarheid | 9 maanden |
Voorbeeldtype | Ontlastingsmonster |
CV | ≤5,0% |
Specificiteit | Er is geen kruisreactiviteit met leverkanker, galwegkanker, schildklierkanker en longkanker |
Toepasselijke instrumenten | QuantStudio®5 Realtime PCR-systemen SLAN-96P Realtime PCR-systemen LightCycler®480 Real-Time PCR-systeem LineGene 9600 Plus realtime PCR-detectiesysteem MA-6000 realtime kwantitatieve thermische cycler |
Werkstroom
Aanbevolen extractiereagens: Macro- en microtest viraal DNA/RNA-kit (HWTS-3001, HWTS-3004-32, HWTS-3004-48, HWTS-3004-96) en macro- en microtest automatische nucleïnezuurextractor (HWTS- 3006).